第八屆全國生物多樣性信息學(xué)研討會在新疆召開
2023年9月15-16日,第八屆全國生物多樣性信息學(xué)研討會在新疆烏魯木齊召開。會議由中國科學(xué)院生物多樣性委員會主辦,中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所和新疆維吾爾自治區(qū)植物學(xué)會承辦,北京生物多樣性科學(xué)研究會協(xié)辦。
會議開幕式由中國科學(xué)院生物多樣性委員會副秘書長、中國科學(xué)院動物研究所紀(jì)力強(qiáng)研究員主持。中國科學(xué)院生物多樣性委員會副主任兼秘書長、中國科學(xué)院植物研究所馬克平研究員和中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所所長、植物學(xué)會理事長張?jiān)?/strong>研究員分別致辭。馬克平研究員在致辭中簡述了生物多樣性信息學(xué)的發(fā)展,就本次大會的大會報(bào)告和專題設(shè)置進(jìn)行了介紹。張?jiān)餮芯繂T介紹了中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所的發(fā)展簡史以及近年來在生物多樣性信息學(xué)方面的進(jìn)展。
為期兩天的會議研討包括了兩個大會報(bào)告環(huán)節(jié)和五個專題分會場。紀(jì)力強(qiáng)研究員和中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所副所長張道遠(yuǎn)研究員主持了第一個大會報(bào)告環(huán)節(jié)。

從左到右、從上到下依次為:馬克平研究員、張?jiān)餮芯繂T、紀(jì)力強(qiáng)研究員和張道遠(yuǎn)研究員
中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園主任楊永平研究員分享了東南亞地區(qū)植物多樣性研究的回顧與展望。他介紹了東南亞地區(qū)植物多樣性研究的簡史和現(xiàn)狀,主要介紹了東南亞生物多樣性中心在開展聯(lián)合科學(xué)考察、重大科學(xué)研究、政策咨詢與人才培養(yǎng)等方面的工作進(jìn)展。并就《昆明-蒙特利爾全球生物多樣性框架》背景下的東南亞植物研究進(jìn)行了展望,對東南亞植物多樣性研究提出加強(qiáng)國內(nèi)合作伙伴之間的工作協(xié)同和數(shù)據(jù)共享、加強(qiáng)與東南亞地區(qū)機(jī)構(gòu)和科學(xué)家的合作交流等建議。

楊永平研究員
張?jiān)?/strong>研究員介紹了中亞干旱區(qū)植物多樣性特征與信息平臺的建設(shè)。中亞干旱區(qū)蘊(yùn)含著豐富而又獨(dú)特的抗逆生物資源,但可自由獲取的生物多樣性信息零散無序、數(shù)字化程度低、共享性差。他主要分享了干旱區(qū)植物多樣性數(shù)字化計(jì)劃的建設(shè)背景和當(dāng)前的進(jìn)展。該計(jì)劃以植物名錄為主線,關(guān)聯(lián)標(biāo)本、文獻(xiàn)、照片、分布、性狀、生境、保護(hù)地、人類活動、機(jī)構(gòu)學(xué)者等,搭建綜合性基礎(chǔ)信息和跨學(xué)科數(shù)據(jù)挖掘環(huán)境,呈現(xiàn)可視化的中亞干旱區(qū)植物多樣性大數(shù)據(jù)平臺。
中國科學(xué)院北京基因組研究所鮑一明研究員以“國家生物信息中心助力生物多樣性研究”為題,介紹了國家生物信息中心(CNCB)-國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心(NGDC)的進(jìn)展。CNCB-NGDC已建成組學(xué)原始數(shù)據(jù)歸檔庫、基因序列數(shù)據(jù)庫、基因組數(shù)據(jù)庫、基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫、基因組變異數(shù)據(jù)庫、甲基化數(shù)據(jù)庫等60余個數(shù)據(jù)資源庫,形成了多組學(xué)、多物種數(shù)據(jù)庫綜合系統(tǒng),并對外提供多組學(xué)數(shù)據(jù)匯交、存儲、分析、工具、文獻(xiàn)等服務(wù),被國際權(quán)威期刊《核酸研究》列為國際主要生物大數(shù)據(jù)中心之一。

鮑一明研究員
紀(jì)力強(qiáng)研究員分享了物種多樣性數(shù)據(jù)平臺的建設(shè)進(jìn)展。他介紹了物種多樣性數(shù)據(jù)平臺的建設(shè)意義和建設(shè)目標(biāo),系統(tǒng)講解了平臺的設(shè)計(jì)思路。目前該平臺已開發(fā)了中國生物物種名錄、中國生物分布地圖、生命百科、物種識別多媒體庫、入侵生物數(shù)據(jù)庫等15個數(shù)據(jù)庫,同時整合了物種數(shù)據(jù)采集與在線分析工具,研發(fā)了生物記、花伴侶、世界有害實(shí)蠅識別等17個平臺/工具。他還介紹了平臺在科學(xué)研究、重要入侵害蟲風(fēng)險(xiǎn)評估、科學(xué)普及、決策支撐等方面的應(yīng)用成果。
中國科學(xué)院地理科學(xué)與資源研究所何洪林研究員介紹了長期生態(tài)觀測的數(shù)據(jù)集成和應(yīng)用研究。他簡述了國外長期生態(tài)觀測數(shù)據(jù)集成和研究發(fā)展趨勢,系統(tǒng)總結(jié)了近年來我國在這一領(lǐng)域的主要進(jìn)展,包括在數(shù)據(jù)集成平臺建設(shè)、數(shù)據(jù)產(chǎn)品開發(fā)共享以及推動聯(lián)網(wǎng)研究、發(fā)展自主知識產(chǎn)權(quán)的生態(tài)評估模型和方法、支撐全國生態(tài)質(zhì)量評估等。他介紹了近期重點(diǎn)推動的我國典型生態(tài)系統(tǒng)狀況本底調(diào)查和歷史數(shù)據(jù)整編,并展望了我國未來長期生態(tài)觀測數(shù)據(jù)集成和研究的發(fā)展重點(diǎn)方向。

何洪林研究員
華東師范大學(xué)張健教授和中國科學(xué)院華南植物園葛學(xué)軍研究員主持了第二個大會報(bào)告環(huán)節(jié)。
山水自然保護(hù)中心執(zhí)行主任史湘瑩博士作了題為“讓生物多樣性數(shù)據(jù)成為保護(hù)的力量”的大會報(bào)告。她介紹了自然觀察項(xiàng)目,以在上海進(jìn)行的“貉以為家”項(xiàng)目為例分享了聯(lián)合多方機(jī)構(gòu)和公眾對國內(nèi)生物多樣性進(jìn)行調(diào)查,建立自然觀察生物多樣性共享數(shù)據(jù)庫的情況;用為行業(yè)提供生物多樣性影響評估工具(BiA)的案例來講述了如何利用公開信息分析生物多樣性影響。她還介紹了通過人工和開發(fā)AI技術(shù)工具建立的社區(qū)監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)與紅外相機(jī)數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)。

葛學(xué)軍研究員、史湘瑩博士和張健教授
張健教授以“公眾科學(xué)與生物多樣性:成也蕭何,敗也蕭何”為題,簡述了公眾科學(xué)在國內(nèi)外的發(fā)展,探討了我國科研人員和公眾對公眾科學(xué)的認(rèn)識,以及如何更準(zhǔn)確地翻譯公眾科學(xué)(citizen science)。他通過上海鄉(xiāng)土植物調(diào)查、基于Biotracks記錄評估植物數(shù)據(jù)完整性、校園植物監(jiān)測與實(shí)驗(yàn)以及綬草觀察四個案例,來評估公眾科學(xué)項(xiàng)目是否可以填補(bǔ)華萊士知識空缺(Wallacean shortfall),討論了開展生物多樣性公眾科學(xué)項(xiàng)目存在的一些壁壘。
中國科學(xué)院植物研究所朱麗副研究員分享了中國生物多樣性信息學(xué)重要進(jìn)展。她從全球視角總結(jié)和剖析了中國生物多樣性信息學(xué)發(fā)展現(xiàn)狀、趨勢和取得的重要進(jìn)展,詳細(xì)介紹了中國生物多樣性大數(shù)據(jù)BioONE共享平臺。該平臺集成了古生物、物種、遺傳資源、植被變化、生態(tài)系統(tǒng)、生態(tài)環(huán)境等跨學(xué)科領(lǐng)域多源異構(gòu)數(shù)據(jù),在揭示生命演化歷程重要階段、制定生物多樣性保護(hù)政策、生態(tài)安全評估與生態(tài)功能區(qū)規(guī)劃、物種與植被智能識別服務(wù)等方面取得了重要進(jìn)展。
來自烏茲別克斯坦塔什干植物園的Seigei Volis教授應(yīng)邀作了題為“Patterns of species richness and endemism”的大會報(bào)告。在生物多樣性評估中,兩種最常用的方法是點(diǎn)到網(wǎng)格地圖和通過堆疊物種分布建模(S-SDM)生成的棲息地適宜性地圖。他利用烏茲別克斯坦的三個單子葉植物屬(蔥屬、郁金香屬和獨(dú)尾草屬)的物種豐富度、加權(quán)特有性(WE)和校正加權(quán)特有性(CWE)這三個指標(biāo)對這兩種方法進(jìn)行了比較。他的研究結(jié)果表明,即使是非常不完整的調(diào)查,S-SDM方法也能為闡明生物多樣性的空間模式提供有價(jià)值的數(shù)據(jù)。

朱麗副研究員和Seigei Volis教授
除大會報(bào)告外,本次大會共有來自5個分會場的41個專題報(bào)告。
水域生物多樣性數(shù)據(jù)共享與利用專題由中國科學(xué)院海洋研究所李富超研究員主持。該專題圍繞陸域湖泊、河流、海洋等不同生態(tài)系統(tǒng),研究對象包括了海洋病毒、魚類、水生植物、深海生物等不同生物類群,現(xiàn)場圍繞科學(xué)數(shù)據(jù)的管理和共享、人工智能、先進(jìn)技術(shù)的應(yīng)用等展開了熱烈討論。




水域生物多樣性數(shù)據(jù)共享與利用專題
人工智能助力生物多樣性信息學(xué)專題由中國科學(xué)院植物研究所李敏高級工程師主持。專題圍繞人工智能在植物、動物在草地、林地及文獻(xiàn)中的訓(xùn)練和識別應(yīng)用進(jìn)行了進(jìn)展介紹,探討了如何通過人工智能更好地服務(wù)于生物多樣性研究及生物多樣性信息學(xué)的發(fā)展。



人工智能助力生物多樣性信息學(xué)專題
生物多樣性數(shù)據(jù)與開放科學(xué)專題由中國科學(xué)院文獻(xiàn)情報(bào)中心許哲平副研究館員和上海辰山植物園陳建平高級工程師主持。專題報(bào)告內(nèi)容豐富,研究角度多樣,涵蓋了學(xué)科發(fā)展、科學(xué)數(shù)據(jù)工程、傳統(tǒng)知識保護(hù)與挖掘和自然教育實(shí)踐。報(bào)告內(nèi)容既有古生物多樣性也有現(xiàn)生生物大數(shù)據(jù)平臺,涉及了海洋生態(tài)和到中亞內(nèi)陸的生物多樣性信息學(xué)研究。




生物多樣性數(shù)據(jù)與開放科學(xué)專題
動物多樣性數(shù)據(jù)共享與利用專題由中國科學(xué)院動物研究所林聰田工程師和生態(tài)環(huán)境部衛(wèi)星環(huán)境應(yīng)用中心施蕾蕾高級工程師主持。專題圍繞動物多樣性數(shù)據(jù)平臺建設(shè)、數(shù)據(jù)獲取等方面開展研討,專題報(bào)告既有昆蟲、鳥類、爬行類等不同動物類群的數(shù)據(jù)監(jiān)測、管理、平臺建設(shè),還包括了生物4D技術(shù)、智慧保護(hù)地建設(shè)、智能監(jiān)測體系等新技術(shù)的應(yīng)用。




動物多樣性數(shù)據(jù)共享與利用專題
植物、微生物多樣性數(shù)據(jù)共享與利用專題由中國科學(xué)院微生物研究所趙明君工程師和中國科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所李文軍副研究員主持。專題報(bào)告圍繞植物和菌物的名稱、多樣性編目數(shù)據(jù)庫建設(shè)和數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)利用及共享等主題展開,研究水平從基因到物種,研究尺度從地區(qū)到全國及全球。




植物、微生物多樣性數(shù)據(jù)共享與利用專題
生物多樣性信息學(xué)是一個新興的、快速成長的學(xué)科領(lǐng)域,它利用信息學(xué)的理論及信息技術(shù)手段,收集、處理和共享以物種和生態(tài)系統(tǒng)為核心的生物多樣性數(shù)據(jù),以支持生物多樣性保護(hù)和持續(xù)利用的研究和決策。
馬克平研究員在閉幕式發(fā)言中分享了他的參會感受。他表示,通過本次大會的研討交流,充分體現(xiàn)了我國生物多樣性信息學(xué)的數(shù)據(jù)量增長快、平臺建設(shè)和數(shù)據(jù)分析能力增強(qiáng)、新技術(shù)和方法不斷得到應(yīng)用等特點(diǎn)。當(dāng)前生物多樣性數(shù)據(jù)已得到了很好的積累,展望未來,他建議科研工作者做好數(shù)據(jù)挖掘,找好科學(xué)問題以及決策者需求,以更好地實(shí)現(xiàn)現(xiàn)有數(shù)據(jù)的價(jià)值,實(shí)現(xiàn)科學(xué)和技術(shù)的“走出去”。
本次會議共有來自烏茲別克斯坦和我國各地62家單位的180人參加了會議。


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