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西安植物園研究發(fā)現(xiàn)植物物種演化的重要驅(qū)動因素
物種的演化過程往往可以通過物種內(nèi)(即核苷酸多樣性和重組率)和物種間(即相對和絕對分化)遺傳多樣性和遺傳分化的綜合統(tǒng)計(jì)信息來進(jìn)行研究。然而，確定導(dǎo)致這些遺傳變異的驅(qū)動因素是研究的一個(gè)重要難點(diǎn)。
近日，陜西省西安植物園(陜西省植物研究所)在進(jìn)化生物學(xué)國際期刊《Molecular Ecology》(IF=6.622，中科院一區(qū)top期刊)在線發(fā)表了題為“Drivers of genomic landscapes of differentiation across a Populus divergence gradient”的研究論文，系統(tǒng)研究了楊屬物種的基因遺傳變異，為準(zhǔn)確認(rèn)識物種演化過程中的驅(qū)動機(jī)制提供了一種新的視角和研究策略。
楊屬物種廣泛分布在歐亞大陸及北美地區(qū)，具有重要的經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值。該屬物種是二倍體植物，基因組較小(<500Mb)。由于物種間存在不同程度的基因流和基因漸滲，所以具有重要的研究價(jià)值。本論文研究團(tuán)隊(duì)利用全基因組重測序技術(shù)對楊屬(Populus)白楊組8個(gè)近緣物種共201個(gè)樣品進(jìn)行了群體遺傳學(xué)分析，通過使用沿分化梯度的一系列物種對，比較調(diào)查了這些物種對間的基因組遺傳變異情況。結(jié)果顯示，不同物種對間的基因組分化模式是比較固定的，連鎖不平衡在這種遺傳變異的模式中起到重要作用。此外，在物種形成初期，基因流和不完全譜系篩選也在遺傳變異過程中扮演了重要的角色。這項(xiàng)研究為更好地理解物種演化的驅(qū)動機(jī)制提供了重要的參考。
陜西省西安植物園助理研究員商慧穎為該論文的第一作者及共同通訊作者。該研究得到了中國國家留學(xué)基金委(CSC)獎學(xué)金、瑞士國家自然科學(xué)基金(SNF)及奧地利博士項(xiàng)目基金(W225-B20)的支持。
原文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/mec.17034
圖1 根據(jù)基因組遺傳多樣性和遺傳分化方式總結(jié)的四個(gè)分化模型及參數(shù)之間的相關(guān)性
圖2 楊屬白楊組物種間群體遺傳結(jié)構(gòu)及進(jìn)化關(guān)系分析
圖3 物種對間不同參數(shù)之間的相關(guān)性沿著分化梯度的變化趨勢
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