中國科學院微生物所尹文兵研究團隊揭示RNA結合蛋白復合體轉錄后調(diào)控真菌次級代謝的新機制
2023年11月14日,中科院微生物研究所尹文兵研究團隊在Nature Communications上發(fā)表題為“Fungal secondary metabolism is governed by an RNA-binding protein CsdA/RsdA complex” 的研究論文。該研究揭示了RNA結合蛋白與全局調(diào)控因子RsdA形成復合體,并在轉錄后水平控制其表達,介導真菌全局次級代謝變化的新機制,對深入理解真菌次級代謝調(diào)控的機制及新穎次級代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)具有重要意義。
本研究從絲狀真菌中鑒定到一個全新的調(diào)控真菌次級代謝的RNA結合蛋白CsdA。為研究其調(diào)控機制,研究團隊通過遺傳敲除、轉錄組學和代謝組學分析,發(fā)現(xiàn)CsdA和全局調(diào)控因子RsdA能夠協(xié)同調(diào)控真菌的次級代謝。在機制上,揭示了RNA結合蛋白通過與RsdA形成核內(nèi)復合體,并在轉錄后水平調(diào)控其pre-mRNA剪接從而協(xié)調(diào)真菌次級代謝的新模式。這種轉錄和轉錄后交叉調(diào)控的新模式不僅有助于理解復雜的真菌次級代謝調(diào)控網(wǎng)絡,還為新天然產(chǎn)物挖掘提供了新策略。

圖1 RNA結合蛋白CsdA與RsdA協(xié)同調(diào)控真菌發(fā)育和全局性代謝變化

圖2 CsdA與RsdA互作并在轉錄后水平控制其表達以協(xié)調(diào)真菌次級代謝的機制
中國科學院微生物研究所博士生宋自力為該論文第一作者,尹文兵研究員為該論文通訊作者。此外,中國科學院微生物研究所劉曉研究員、美國威斯康辛大學麥迪遜分校的Nancy Keller教授和堪薩斯大學的Berl Oakley教授等專家為本研究提供了大力支持。本研究得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金、中國科學院基礎前沿科學研究計劃、中國科學院基礎前沿科學研究計劃從0到1原始創(chuàng)新項目和中國科學院戰(zhàn)略生物資源計劃等項目的支持。
原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-43205-2

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